甘酒に含まれるオリゴ糖、食物繊維は腸内環境改善のための善玉菌を増やすのに効果があると言われています。善玉菌は腸内で乳酸や酢酸を作り出すことで腸内を酸性し、悪玉菌の増殖を抑え腸の動きを活発にしたり、食中毒菌や病原菌から予防する効果があることがわかっています。また甘酒は「飲む点滴」ともいわれるくらい様々な栄養素がバランスよく含まれています。 シナモン、生姜を入れることで体を温める効果も期待できます。

生姜は温めて使うことで体全体を温める効果がある。牛乳を豆乳・アーモンドミルクで代用しても美味しい。